Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms