Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Use1Q9CQ56 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms