Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms