Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms