Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GpnmbQ99P91 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms