Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms