Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms