Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms