Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms