Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms