Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms