Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms