Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms