Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdxdc1Q99K01 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms