Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms