Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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