Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms