Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms