Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms