Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms