Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms