Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms