Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps3Q91VB4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms