Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms