Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms