Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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