Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ldQ8VCH2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms