Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms