Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim29Q8R2Q0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms