Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms