Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms