Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fbxo18Q8K2I9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fbxo18Q8K2I9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fbxo18Q8K2I9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fbxo18Q8K2I9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxo18Q8K2I9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms