Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim68Q8K243 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim68Q8K243 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim68Q8K243 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim68Q8K243 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim68Q8K243 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim68Q8K243 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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