Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snrnp27Q8K194 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snrnp27Q8K194 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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