Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms