Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms