Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc3Q8CFZ4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc3Q8CFZ4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc3Q8CFZ4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms