Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd1bQ8CFT2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms