Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp27Q8CEG8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp27Q8CEG8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp27Q8CEG8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms