Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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