Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nrip1Q8CBD1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms