Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf2Q8CB19 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms