Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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