Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ska3Q8C263 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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