Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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