Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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