Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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