Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms