Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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