Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prpf18Q8BM39 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prpf18Q8BM39 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prpf18Q8BM39 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf18Q8BM39 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Prpf18Q8BM39 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf18Q8BM39 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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